Un seul test pourrait détecter presque tous les virus

Un nouveau test qui détecte pratiquement tous les virus qui infectent les personnes et les animaux a été mis au point par des chercheurs de la faculté de médecine de l’Université de Washington à Saint-Louis, selon les résultats publiés dans la revue. Recherche sur le génome.
Le nouveau test peut détecter un large éventail de virus, y compris les norovirus.

Plusieurs milliers de virus sont connus pour provoquer des maladies chez les humains et les animaux, et leur diagnostic correct peut être long et coûteux, impliquant de nombreux tests.

Les virus présents dans et sur le corps humain sont connus sous le nom de virome. Selon l'auteur principal de l'étude, le Dr Gregory Storch, professeur de pédiatrie Ruth L. Siteman, dans un processus connu sous le nom de «séquençage amélioré du virome», les chercheurs ont mis au point une méthode niveaux très bas. "

Jusqu'à présent, aucun test n'a été suffisamment sensible pour détecter de faibles niveaux de virus viraux. De nombreux tests se limitent à détecter uniquement les virus suspectés d'être responsables de la maladie d'un patient.

Le nouveau test pourrait être utilisé pour détecter des épidémies de virus mortels tels qu'Ebola, Marburg et le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), ainsi que des virus plus courants, notamment les rotavirus et les norovirus, qui causent tous deux des infections gastro-intestinales graves.

L'équipe s'attend à ce que le test soit utile dans les cas où le test standard ne révèle pas un diagnostic ou lorsque l'on ignore ce qui a provoqué une épidémie.

Le test révèle des virus non détectés par des tests standard

Le nouveau test - appelé ViroCap - a été montré sur des échantillons de patients pour détecter les virus non détectés par les tests standard.

Le test séquence et détecte les virus avec la même sensibilité que les tests de réaction en chaîne de la polymérase (PCR), qui sont largement utilisés dans les laboratoires cliniques et considérés comme «l'étalon-or».

Cependant, bien que les tests PCR puissent détecter jusqu'à 20 virus similaires à la fois, il semble que ViroCap pourrait théoriquement tester la quasi-totalité des virus.

Pour développer le test, les chercheurs ont ciblé des segments uniques d’ADN ou d’ARN provenant de tous les groupes de virus connus infectant les humains et les animaux: 2 millions d’éléments uniques de matériel génétique.

Ces tronçons de matériau sont utilisés comme sondes pour prélever des virus dans des échantillons de patients présentant une correspondance génétique. Le matériel viral apparié est ensuite analysé en utilisant un séquençage génétique à haut débit.

L'équipe suggère que, à mesure que de nouveaux virus sont découverts, leur matériel génétique pourrait facilement être ajouté au test.

L'évaluation montre que ViroCap est 52% plus efficace

Les chercheurs ont évalué le nouveau test en prélevant deux séries d’échantillons biologiques, par exemple des échantillons de sang, de selles et de sécrétions nasales, provenant de patients de l’hôpital pour enfants de St. Louis.

Des tests standard ont détecté des virus chez 10 des 14 patients, mais le nouveau test a révélé des virus chez les quatre enfants que les tests antérieurs avaient manqués.

Parmi les virus courants non détectés par le test standard figurent la grippe B, cause de la grippe saisonnière, le paréchovirus, un virus gastro-intestinal et respiratoire léger, le virus herpès-1 responsable de l’herpès labial et le virus varicelle-zona. varicelle.

Dans un deuxième groupe d'enfants atteints de fièvres inexpliquées, le test standard a détecté 8 virus sur 11, mais le nouveau test en a détecté sept autres, notamment un virus respiratoire appelé adénovirus humain B type 3A, généralement inoffensif mais pouvant provoquer des infections graves chez certains patients. .

Au total, le nombre de virus détectés dans les deux groupes de patients est passé de 21 à 32, soit une augmentation de 52%.

Le nouveau test permet également d'identifier facilement les sous-types de virus, car il contient des informations génétiques détaillées sur diverses souches de virus particuliers.

Par exemple, alors qu'un test standard identifiait un virus comme la grippe A, qui cause la grippe saisonnière, le nouveau test indiquait que le virus était un sous-type particulièrement dur appelé H3N2.

Lors de la dernière saison grippale, le H3N2 a causé environ 36 000 décès aux États-Unis. Cette information pourrait mener à un traitement plus efficace chez des patients tels que les jeunes enfants, les personnes âgées et les personnes dont le système immunitaire est affaibli.

L'auteur de l'étude, Todd Wylie, a déclaré:

"Le test est tellement sensible qu'il détecte également les souches de virus étroitement apparentées génétiquement. Les tests génétiques actuels ne permettent pas de distinguer les légères variations génétiques entre les virus et compliquent la capacité des médecins à détecter toutes les variantes à l'aide d'un seul test."

La technologie développée est mise à la disposition des scientifiques et des cliniciens du monde entier pour le bénéfice des patients et de la recherche.

Des recherches supplémentaires sont encore nécessaires pour valider l'exactitude du test, ce qui signifie qu'il peut s'écouler plusieurs années avant qu'il soit disponible sur le plan clinique, mais les scientifiques pourront utiliser cette technologie pour étudier les virus dans un contexte de recherche.

Les auteurs espèrent également qu'il pourrait être modifié pour détecter des agents pathogènes autres que les virus, tels que les bactéries, les champignons et autres microbes. Kristine Wylie, co-auteur de l'étude, pourrait également mettre en évidence des gènes indiquant qu'un agent pathogène résiste au traitement par des antibiotiques ou d'autres médicaments.

Le nouveau test permettra une meilleure compréhension de ces virus et du rôle qu'ils jouent dans la santé du corps.

Plus tôt cette année, Nouvelles médicales aujourd'hui ont rapporté un test appelé VirScan qui, selon les chercheurs, peut détecter toute l'histoire virale d'une personne en scannant une seule goutte de sang.

Pemphigus foliaceus: ce qu'il faut savoir

Table des matières Qu'est-ce que PF? Symptômes Causes Diagnostic Traitement Autres types de pemphigus Pemphigus foliaceus fait partie du groupe pemphigus des maladies auto-immunes. Les maladies auto-immunes surviennent lorsque le système immunitaire attaque les tissus sains. Dans le pemphigus foliacé, le système immunitaire endommage les cellules de la peau appelées kératinocytes.

(Health)

Le cerveau vieillissant bénéficie d'une expérience sensorielle persistante

Les scientifiques ont cru pendant des décennies que la plus grande partie du câblage du cerveau était établie au moment où une personne a atteint l'adolescence. Maintenant, une nouvelle étude publiée dans Neuron révèle que même à l’âge adulte, des changements dans les expériences sensorielles peuvent entraîner un re-câblage massif du cerveau. Des chercheurs du Max Planck Florida Institute (MPFI) et de la Columbia University ont découvert que le recâblage implique des fibres qui fournissent un apport primaire au cortex cérébral, impliqué dans la cognition, la perception sensorielle et le contrôle moteur.

(Health)