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La découverte de médicaments contre le cancer reçoit un coup de pouce d'une grande base de données 3D

L'ajout d'améliorations 3D à la plus grande base de données au monde pour la recherche sur le cancer et la découverte de médicaments devrait stimuler considérablement les chercheurs à la recherche de moyens plus efficaces de développer de nouveaux traitements contre le cancer.
La base de données contient désormais les structures 3D de près de 3 millions de niches à la surface de près de 110 000 molécules cancérigènes.

Ainsi, les chercheurs qui ont effectué des mises à jour majeures de canSAR, une vaste base de données sur le cancer accessible au public, exploitent les connaissances acquises dans des domaines tels que la biologie, la chimie, la pharmacologie et la biologie structurale.

L'équipe de l'Institut de recherche sur le cancer (ICR) à Londres, au Royaume-Uni, décrit les nouvelles améliorations apportées à canSAR dans la revue. Recherche sur les acides nucléiques.

Une caractéristique importante de la mise à jour est l'ajout de structures 3D de protéines défectueuses et de cartes des réseaux de communication du cancer.

D'autres améliorations incluent de meilleurs outils de navigation et de recherche, de nouveaux résumés de maladies et de lignées cancéreuses, ainsi que des outils d'analyse de lots améliorés, notent les auteurs du projet financé par Cancer Research UK.

L'auteur principal, le Dr Bissan Al-Lazikani, qui a dirigé le développement de canSAR et dont les recherches à l'IC se concentrent sur le développement et l'application de techniques informatiques multidisciplinaires pour soutenir la découverte de médicaments, déclare:

"Notre objectif est que les cancérologues soient armés des données dont ils ont besoin pour mener des recherches vitales sur les médicaments les plus intéressants du futur."

La base de données canSAR existe depuis 2011 et vise à utiliser des «données volumineuses» pour obtenir une image détaillée du comportement de la plupart des molécules humaines.

La base de données contient déjà des milliards de mesures expérimentales qui cartographient l’effet d’un million de médicaments et de produits chimiques sur les protéines humaines. Il a également ajouté ces informations à des données génétiques et à des résultats d'essais cliniques.

Dr. Al-Lazikani explique pourquoi la ressource est si utile:

"Les scientifiques doivent trouver toutes les informations sur un gène ou une protéine défectueux pour savoir si un nouveau médicament pourrait fonctionner. Ces données sont vastes et dispersées, mais la base de données canSAR les rassemble et leur apporte une valeur ajoutée en identifiant les liens cachés informations facilement. "

La plus grande base de données sur la découverte de médicaments contre le cancer au monde

La dernière mise à jour signifie que les chercheurs - à l'aide de l'intelligence artificielle - peuvent rechercher des niches utiles à la surface de molécules cancérigènes défectueuses qui pourraient être utilisées par de nouveaux médicaments pour bloquer leur effet.

La base de données contient désormais les structures 3D de près de 3 millions de niches à la surface de près de 110 000 molécules cancérigènes.

Une autre nouvelle caractéristique est que les scientifiques peuvent identifier les voies de communication pour bloquer les cellules tumorales.

Dr. Al-Lazikani dit que la base de données est la plus grande du genre au monde avec plus de 140 000 utilisateurs provenant de plus de 175 pays.

Elle et son équipe y contribuent constamment et «développent régulièrement de nouvelles technologies d’intelligence artificielle qui aident les scientifiques à faire des prédictions et à concevoir des expériences», ajoute-t-elle.

Le Dr Kat Arney, responsable de l'information scientifique à Cancer Research UK, dit que tout ce qui réduit le temps et les coûts pour trouver de nouveaux traitements contre le cancer aidera à amener la prochaine génération de médicaments aux patients encore plus tôt.

"Cette base de données met à la disposition des scientifiques du monde entier une masse d'informations scientifiques détaillées sur le cancer et accélérera les avancées cruciales en matière de découverte de médicaments, sauvant ainsi davantage de vies".

La base de données canSAR est disponible en ligne via l'ICR.

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