Les champignons intestinaux peuvent jouer un rôle clé dans la santé métabolique

Une nouvelle étude publiée dans la revue mSphere suggère que les champignons intestinaux peuvent être tout aussi importants que les bactéries pour comprendre l'obésité et la santé métabolique.
Selon une nouvelle étude, les bactéries intestinales et les champignons intestinaux s’influencent mutuellement dans une interaction complexe et un régime riche en graisses affecte cette dynamique.

Les chercheurs ont été dirigés par la Dre Cheryl Gale, professeure agrégée au département de pédiatrie de l’Université du Minnesota, à Minneapolis.

Comme l'expliquent le Dr Gale et ses collègues, des recherches antérieures ont montré que l'obésité est associée à des changements dans les bactéries intestinales.

La plupart des études ont donc porté sur la façon dont un régime riche en graisses modifie le microbiome intestinal, laissant le rôle des champignons intestinaux ignoré.

La nouvelle étude vise à combler cette lacune dans la recherche, en particulier parce qu'il a récemment été démontré que les champignons intestinaux affectent l'inflammation intestinale.

Étudier les champignons intestinaux chez la souris

Le Dr Gale et son équipe ont nourri deux groupes de souris avec deux régimes différents: un groupe riche en graisses et un groupe normal (le groupe témoin).

Les souris nourries avec un régime riche en graisses ont pris du poids et ont présenté des marqueurs métaboliques de l'obésité, tels que la résistance à l'insuline.

Après avoir analysé le microbiote bactérien et fongique, les chercheurs ont découvert que les souris nourries avec un régime riche en graisses présentaient des compositions bactériennes et fongiques «significativement différentes» que celles nourries avec un régime alimentaire normal.

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Par exemple, en ce qui concerne la composition bactérienne, l’étude a révélé "une augmentation de la Firmicutes et [a] diminution de Bacteroidetes en réponse à [un] régime riche en graisses. "Et comme l'expliquent les auteurs, cela est conforme aux conclusions précédentes.

En ce qui concerne les champignons, les chercheurs ont constaté que les souris nourries avec un régime standard présentaient une augmentation de six taxons fongiques. En comparaison, aucun taxa fongique n’a été trouvé dans le groupe à forte teneur en graisse.

En outre, le nombre de corrélations dites de co-abondance entre certains champignons et bactéries diminuait "de manière spectaculaire" chez les souris nourries avec un régime riche en graisses, par rapport à celles recevant un régime standard.

Les auteurs de l'étude concluent:

"Les résultats de cette étude apportent la preuve que les régimes fongiques et inter-royaux sont perturbés par un régime riche en graisses, soutenant ainsi l'inclusion d'analyses communautaires fongiques dans des études visant à découvrir de nouvelles connexions entre les microbiomes intestinaux et la santé métabolique . "

Le rôle des champignons intestinaux dans l'obésité a été négligé

"Ces résultats", écrivent les auteurs, "suggèrent un rôle pour les champignons [...] dans l'association entre les microbiomes intestinaux et l'obésité". Actuellement, plus du tiers des adultes aux États-Unis sont obèses et entre 15 et 20% des enfants et adolescents américains souffrent de ce trouble métabolique.

Le Dr Gale note que le rôle des champignons dans la compréhension de l'obésité a été négligé dans la communauté des chercheurs et que les méthodes d'étude disponibles devraient refléter le besoin de prêter plus d'attention aux champignons.

"Le développement de méthodes n’a pas été à la hauteur des bactéries. Il faut des méthodes très sensibles car les champignons sont moins abondants", dit-elle. "Nous n'avons pas développé les bases de données de séquences pour les champignons comme pour les bactéries."

"Nous devons vraiment examiner tous les microbes et comment ils interagissent les uns avec les autres pour avoir une idée complète de la structure et de la fonction du microbiome chez un individu donné", explique le Dr Gale.

"Non seulement nous affectons la communauté des champignons par des changements alimentaires", ajoute-t-elle, "mais nous constatons également que les relations entre les champignons et les bactéries changent".

"Ces royaumes ne sont pas isolés. Si on change, cela aura un impact sur la structure de la communauté et peut-être aussi sur la structure fonctionnelle des autres royaumes. Je pense que c'est là que le microbiome évolue", conclut le Dr Gale.