Lancement du vaste catalogue d'ADN du cancer infantile

En publiant un vaste catalogue de données ADN complètes sur les cancers infantiles à la communauté scientifique mondiale, une équipe du St Jude Children Research Hospital de Memphis, au Tennessee, espère accélérer les progrès dans la recherche de causes et de nouveaux traitements contre le cancer. maladies.
Le catalogue contient des séquences complètes du génome, essentiellement des cartes d'ADN complètes, provenant de 260 enfants atteints de cancer. Il y a 520 séquences en tout, comprenant des ensembles appariés d'échantillons de tissus normaux et tumoraux.
Les scientifiques qui publient les données travaillent sur le projet de génome du cancer pédiatrique de l’Université de Washington, qui devrait classer plus de 1 200 génomes d’ici la fin de l’année.
Le communiqué, considéré comme le plus grand de son genre à la communauté scientifique, a été annoncé dans le cadre d’un article de Perspective publié dans Génétique de la nature mardi.
Pour assurer une précision maximale des données, chaque échantillon est séquencé 30 fois.
L'information sera précieuse non seulement pour les chercheurs dans le domaine du cancer, mais aussi pour les scientifiques qui étudient toutes sortes de maladies.
Les chercheurs de St Jude cherchent à identifier les différences entre les génomes de cellules saines et cancéreuses afin d'identifier les causes de plus d'une demi-douzaine de cancers mortels chez l'enfant.
Leur travail a déjà donné lieu à plusieurs découvertes importantes, dont ils ont fait l’objet dans de grandes revues scientifiques.
Certaines de ces découvertes comprennent des informations importantes sur les cancers agressifs de la rétine, du tronc cérébral et du sang chez les enfants. Par exemple, tout en étudiant ce qui se cache derrière le développement rapide du rétinoblastome de la tumeur oculaire, les chercheurs du projet ont identifié un nouvel agent anticancéreux prometteur.
Dans une autre partie du projet, des scientifiques étudiant une leucémie infantile mortelle appelée ETP-ALL (abréviation de leucémie lymphoblastique aiguë précurseur T précoce) ont découvert des différences inattendues dans le génome susceptibles d'améliorer le diagnostic et le traitement des enfants atteints de la maladie.
James Downing est directeur scientifique de St Jude et responsable du projet à St Jude. Il a déclaré à la presse que ces découvertes, et d’autres, n’auraient pas été possibles sans le projet sur le génome du cancer pédiatrique et:
"En partageant l’information, nous espérons que d’autres chercheurs pourront utiliser cette riche ressource pour mieux comprendre de nombreux autres types de maladies chez les enfants et les adultes", at-il déclaré.
Le projet de génome du cancer pédiatrique est différent car, contrairement à de nombreux projets sur le génome, il produit des ensembles de données sur le génome entier, qui montrent des séquences d’ADN entières, au lieu de se concentrer sur des gènes individuels.
Ces ensembles de données donnent une image beaucoup plus riche et complète des modifications de l’ADN derrière les causes et la progression de la maladie.
Richard K Wilson, directeur de l’Institut du génome de la faculté de médecine de l’Université de Washington à St Louis, a déclaré que cette approche avait révélé des changements inhabituels et «mystiques» dans les cellules cancéreuses de nombreux patients.
Le projet a également montré qu'il existe des différences marquées entre les cancers chez l'enfant et l'adulte, soulignant pourquoi il est important de développer des traitements séparés pour chacun.
Les chercheurs pourront accéder aux données en ligne en soumettant une demande à l’archive européenne du génome-phénome.
Écrit par Catharine Paddock PhD

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