Les protéines de nettoyage d'ADN peuvent également prévenir le cancer

Les scientifiques pensaient autrefois que les protéines BAF limitaient leur activité au ménage cellulaire. Mais ensuite, ils ont découvert que ces complexes font plus que contribuer au conditionnement et au maintien de l'ADN dans les cellules: il semble qu'ils suppriment également le développement de tumeurs dans de nombreux types de tissus. Une nouvelle étude de la faculté de médecine de l'université de Stanford aux États-Unis révèle que les protéines BAF sont mutées dans environ un cancer humain sur cinq.
L'auteur principal Gerald Crabtree, qui est également membre du Howard Hughes Medical Institute à Chevy Chase, Maryland, et ses collègues, écrivent sur leurs conclusions dans un article publié en ligne dans Génétique de la nature le 5 mai.

BAF Help Package ADN

Le FBA est un complexe de protéines connu sous le nom de complexes régulateurs de la chromatine. Ils travaillent à garder l'ADN bien emballé à l'intérieur des cellules, tout en permettant l'accès pour activer et désactiver les gènes et pour permettre la copie. L'énormité de cette tâche est stupéfiante, comme l'explique Crabtree, également membre du Stanford Cancer Institute:
"D'une manière ou d'une autre, ces complexes régulateurs de la chromatine parviennent à comprimer près de deux mètres d'ADN dans un noyau environ un millième de la taille d'une tête d'épingle, sans compromettre la capacité de l'ADN à être répliqué et exprimé dans différents tissus." tous sans emmêler. "

Complexes BAF en tant que suppresseurs de tumeurs

L'équipe de Crabtree's Lan étudie depuis de nombreuses années les complexes de BAF. Il y a près de 20 ans, ils ont révélé que des complexes de ce type étaient probablement des suppresseurs de tumeurs.

Plus récemment, dans la revue La nature, ils ont signalé que les sous-unités de commutation dans les complexes BAF peuvent transformer les fibroblastes humains en neurones, suggérant qu'ils jouent également un rôle instructif dans le développement cellulaire et, éventuellement, le cancer.
Dans cette dernière étude, ils montrent que les complexes de BAF "sont mutés dans près de 20% de toutes les tumeurs malignes humaines examinées à ce jour", explique Crabtree.
Les résultats montrent également que les mutations ont une large portée, comparable à celle d'un autre suppresseur de tumeur bien connu, p53.
"Bien que nous sachions que ce complexe était susceptible de jouer un rôle dans la prévention du cancer, nous n'avons pas réalisé à quel point il serait important", déclare Cigall Kadoch, co-premier auteur et chercheur postdoctoral.

Les caractéristiques des mutations de BAF semblent précéder certains cancers

Pour l'étude, Crabtree et ses collègues ont rassemblé des expériences biochimiques avec des données extraites de 44 études antérieures. Le travail n'aurait pas été possible sans la possibilité d'appliquer une technologie de séquençage de l'ADN à l'échelle du génome très précise à des échantillons individuels de tumeurs humaines.
L'équipe a découvert que certains types de mutations dans les sous-unités des complexes BAF semblent précéder des cancers spécifiques. Par exemple, un modèle suggère que le cancer de l'ovaire suivra le cancer du côlon suivra.
Lorsqu'ils ont découvert que, dans certains cas, même une seule mutation dans une sous-unité était suffisante pour déclencher le cancer, ils ont réalisé à quel point les complexes BAF devaient jouer un rôle important dans la suppression des tumeurs.
Kadoch dit qu’ils en ont trouvé un exemple dans «un type de mutation appelé translocation chromosomique dans le gène codant l’une de ces sous-unités nouvellement identifiées, SS18, est connu pour être la marque d’un cancer appelé sarcome synovial».
"Il s'agit clairement de l'événement oncogénique moteur et très souvent de la seule anomalie génomique dans ces cancers", ajoute-t-elle.

19,6% de toutes les tumeurs humaines montrées au moins une mutation BAF

Les chercheurs ont identifié 7 protéines auparavant inconnues comme composants du FBA. Ils ont ensuite examiné des études antérieures qui avaient séquencé l'ADN de tumeurs humaines pour déterminer la fréquence de mutation des membres du complexe.
Ils ont été surpris de constater que 19,6% de toutes les tumeurs humaines présentaient une mutation dans au moins une des sous-unités du complexe. De même, pour certains cancers, comme le sarcome synovial, chaque échantillon de tumeur analysé présentait une mutation dans une sous-unité BAF.
L'équipe conclut que les complexes BAF non mutés doivent jouer un rôle clé dans la prévention du cancer dans de nombreux types de tissus:
"Ainsi, le fonctionnement correct des complexes BAF polymorphes peut constituer un mécanisme majeur de suppression tumorale", écrivent-ils.

Autres questions à explorer

L'équipe veut maintenant savoir exactement comment les mutations interfèrent avec la capacité du complexe à supprimer les tumeurs. Par exemple, favorisent-ils le cancer en interférant avec le cycle cellulaire? Ou bloquent-ils la façon dont le complexe est positionné sur l'ADN?
L'étude est un autre exemple de certaines des découvertes surprenantes qui ont été publiées récemment sur le rôle des mutations dans le cancer. En février 2013, un chercheur du MIT a révélé que certaines mutations du génome des cellules cancéreuses stimulaient activement la croissance tumorale, mais que d'autres le ralentissaient ou même l'arrêtaient.
Écrit par Catharine Paddock PhD