Appariement De Patients Aux Essais De Cancer Axés Sur Le Biomarqueur - Le séquençage génétique pourrait aider

Les chercheurs sur le cancer développent un catalogue de cibles potentielles pour de nouveaux traitements, tout en continuant à identifier les mutations génétiques qui alimentent différents sous-types de cancer.
Récemment, le Comprehensive Cancer Center de l'Université du Michigan et le Michigan Center for Translational Pathology (MCTP) ont mené une enquête pilote. L'objectif de cette étude était de résoudre les problèmes pratiques auxquels les chercheurs sont confrontés pour séquencer rapidement et systématiquement du matériel génétique provenant de personnes atteintes d'un cancer avancé ou résistant au traitement, afin qu'elles puissent être associées aux essais cliniques existants basés sur les biomarqueurs identifiés. Les résultats de l’enquête exploratoire, connue sous le nom de Michigan Oncology Sequencing Project (MI-ONCOSEQ), sont publiés dans Médecine translationnelle des sciences.
Le Dr Dan Robinson, chercheur postdoctoral au MCTP, co-chercheur principal explique:

"Nous ne parlons pas seulement d'examiner quelques gènes où des mutations sont connues, ou même d'une centaine de gènes. Nous parlons de la capacité à séquencer plus de 20 000 gènes et non seulement à rechercher des mutations génétiques individuelles, mais à des combinaisons de mutations. "

Les chercheurs ont découvert que l'identification du «paysage mutationnel» d'un individu offre une technique prometteuse pour déterminer quels essais pourraient aider le patient le mieux possible.
Le D r Sameek Roychowdhury, chargé de recherche clinique en hématologie et oncologie à la faculté de médecine U-M, a déclaré:

"Le séquençage à haut débit exploite les dernières avancées technologiques pour traiter des millions d'informations génétiques, ce qui nous permet de cartographier les aberrations génétiques d'un cancer. L'utilisation de cette technique pour identifier des options de traitement par biomarqueurs ouvre vraiment la voie à l'oncologie personnalisée. un certain nombre de défis logistiques, en particulier parmi ceux qui rendent les résultats disponibles de manière rentable et dans un délai cliniquement pertinent.
Il y a une ou deux décennies, ce type de séquençage aurait coûté des millions voire des milliards de dollars, mais la technologie progresse si rapidement que nous parlons maintenant de milliers, ce qui fait de l'utilisation généralisée une réelle possibilité. "

Le cancer peut provenir d'un ensemble de changements génétiques, y compris des ajouts, des suppressions, des réarrangements et des substitutions dans le code génétique.
Roychowdhury déclare:

"Différents processus de séquençage sont nécessaires pour trouver différents types d'altérations. Mais pour être rentable, il doit y avoir un équilibre entre une analyse large et une analyse approfondie."

Les enquêteurs ont commencé par examiner l'approche de séquençage des chercheurs sur les tumeurs du cancer de la prostate qui avaient été développées chez la souris. Plus tard, l'étude a recruté deux personnes dans un projet pilote clinique: une patiente présentant un cancer colorectal et une autre présentant un mélanome. Pour les deux participants, des essais cliniques potentiels ont été identifiés.
Cependant, les enquêteurs avertissent que tous les individus ne correspondront pas à une étude existante. Certaines personnes présentant une certaine mutation pourraient être exclues car elles ont, par exemple, un cancer de la prostate, mais un essai ne porte que sur des personnes atteintes d'un cancer du sein. Selon les chercheurs, cette méthode offre également l’occasion d’aborder les essais cliniques de manière novatrice, en passant d’une approche axée sur les tissus à des aberrations génétiques partagées entre différents types de cancer.
Ils avertissent que l'inscription à un essai ne garantit pas que l'individu bénéficiera du traitement.
Parmi les obstacles à une mise en ?uvre étendue, citons le recours à un comité multidisciplinaire de séquençage séquentiel pour interpréter les résultats complexes du séquençage, la gestion des ressources informatiques nécessaires et une méthode pour détecter les découvertes génétiques accidentelles, notamment le risque d'hémochromatose. que le corps absorbe trop de fer.

Il est essentiel d’obtenir un délai de traitement de quatre semaines pour obtenir des résultats, car c’est la période pendant laquelle les patients doivent généralement attendre que les traitements ne réussissent pas avant de commencer un essai clinique.
Le Dr Arul Chinnaiyan, enquêteur principal, directeur du MCTP, enquêteur du Howard Hughes Medical Institute et professeur de pathologie S.P. Hicks à la faculté de médecine U-M, a déclaré:

"Une fois que certains des obstacles pratiques et technologiques sont résolus, nous envisageons une série d’essais basés sur les mutations et les voies pour les thérapies ciblées disponibles, avec une éligibilité basée sur une évaluation moléculaire. De plus, si les patients sont traités avec des thérapies ciblées cela pourrait aussi aider à révéler les mécanismes de la résistance et éclairer les futurs essais de thérapies combinées. "

Selon M. Chinnaiyan, le travail n'a été possible que grâce à la collaboration et au travail d'équipe. Les docteurs Moshe Talpaz, Stephen Gruber et Kenneth Pienta, des médecins U-M, ont joué un rôle essentiel dans la mise en ?uvre clinique de ce protocole exploratoire.
L'équipe espère qu'au cours des 5 à 10 prochaines années, ce type de séquençage sera plus largement disponible. Les patients atteints de cancer sont encouragés à parler à leur médecin en ce qui concerne les possibilités d'essais cliniques.
Écrit par Grace Rattue