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Gamers Crack SIDA Puzzle

Dans ce qui pourrait être une avancée significative dans la recherche sur le VIH / SIDA, les joueurs en ligne jouant à un jeu appelé Foldit ont découvert un problème clé de structure protéique qui a amené des scientifiques à se tromper pendant des années. Et les joueurs l'ont fait en trois semaines. Vous pouvez lire un compte rendu scientifique de la manière dont les chercheurs ont recruté des acteurs de Foldit pour travailler sur le problème de modélisation et, finalement, résoudre la structure cristalline de la protéase rétrovirale M-PMV dans un article publié en ligne cette semaine. Nature Structural & Molecular Biology.
Foldit invite les joueurs à prédire les structures protéiques. Le jeu a été développé par des chercheurs de l’Université de Washington, comme moyen délibéré de faire participer les joueurs en résolvant des problèmes scientifiques. Le jeu exige qu'ils utilisent des compétences de réflexion spatiale et critique pour construire des modèles 3D de molécules de protéines. Dans ce cas, ils ont été invités à construire des modèles de M-PMV, une enzyme protéase qui joue un rôle clé dans la réplication d'un virus similaire au VIH dans les cellules. Peu de joueurs avaient de l'expérience en biochimie.
En résolvant le mystère de la structure 3D de la protéine, les joueurs ont aidé les scientifiques à faire un pas en avant dans la mise au point d'un médicament capable d'empêcher la propagation de virus tels que le VIH.
Les chercheurs écrivent:
"Fait remarquable, les acteurs de Foldit ont été en mesure de générer des modèles de qualité suffisante pour un remplacement moléculaire réussi et une détermination ultérieure de la structure. La structure perfectionnée fournit de nouvelles informations pour la conception de médicaments antirétroviraux."
L’étude est un bon exemple de la manière dont les personnes compétentes dans le domaine des jeux vidéo peuvent s’impliquer dans la science et aider à résoudre un large éventail de problèmes.
Dans Foldit, les joueurs tentent de prédire comment les protéines se plient. Lorsque les joueurs jouent au jeu, leurs actions pour tenter de résoudre le problème sont enregistrées et utilisées pour créer des algorithmes permettant aux ordinateurs d’accroître leur raisonnement spatial.
La résolution des problèmes dans le jeu aide les scientifiques à mieux comprendre comment les cellules fabriquent des protéines, un processus appelé biosynthèse. Un défi particulier dans ce domaine consiste à comprendre comment certaines protéines se replient en structures tridimensionnelles.
Pour gagner, les joueurs doivent faire trois choses: à quel point vous protégez la protéine en 3D, à quel point vous cachez les bits hydrophobes de la molécule et comment vous résolvez les conflits. Les joueurs n'ont pas à comprendre ces facteurs pour jouer.
Le jeu leur présente une nouvelle protéine et s'en va, essayant de la plier pour trouver sa forme idéale. Quand ils frappent un coup correct, qui frappe ces facteurs, ils obtiennent des points. Les joueurs peuvent dialoguer en ligne et comparer leurs solutions. C’est grâce aux stratégies de partage que les joueurs du monde entier ont résolu le problème de la PMV.
Seth Cooper, concepteur principal de Foldit et co-auteur du journal, a déclaré à la presse:
"Les gens ont des compétences de raisonnement spatial, quelque chose avec lequel les ordinateurs ne sont pas encore bons."
"Les jeux fournissent un cadre pour rassembler les forces des ordinateurs et des humains", a-t-il ajouté.
Écrit par Catharine Paddock PhD

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