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Les virus présents dans les excréments humains âgés de 700 ans ont des gènes de résistance aux antibiotiques

Bien que creuser à travers une latrine à partir du 14ème siècle ne soit pas la tâche la plus fascinante, les scientifiques ont trouvé des virus contenant des gènes de résistance aux antibiotiques dans les excréments humains fossilisés de la Belgique ancienne.

Les excréments remontent à bien avant l'utilisation des antibiotiques, et les enquêteurs affirment que cela prouve que l'intestin humain est resté inchangé après des siècles.

Ils publient les résultats de leur étude dans la revue Microbiologie appliquée et environnementale.

Mais comment trouver des échantillons de matières fécales il y a 700 ans? Les scientifiques affirment que leurs recherches ont commencé lorsqu'un projet de rénovation urbaine en Belgique a permis de découvrir des latrines des années 1300 sous une place.

En 1996, le spécimen a été fouillé et recueilli à l'intérieur d'un tonneau fermé, qui servait souvent de toilette à cette époque. L’équipe note que le canon était toujours intact lors de sa découverte, ce qui suggère que l’échantillon était protégé de la contamination pendant des siècles.

De plus, l’équipe a pris des «précautions importantes» pour éviter la contamination de l’échantillon tant sur le site que dans le laboratoire.

Après avoir analysé les excréments anciens, l'équipe a découvert des phages, virus qui infectent les bactéries, plutôt que des organismes eucaryotes, tels que les plantes, les animaux et les champignons.

Ils ont comparé le virome d'ADN de l'échantillon fossilisé avec les viromes de 21 échantillons de selles humaines modernes et ont découvert que plusieurs des séquences virales étaient liées à des virus connus aujourd'hui pour infecter les bactéries dans les selles.

Les chercheurs disent que cela inclut à la fois les bactéries qui vivent inoffensivement - et parfois utilement - dans les intestins et les agents pathogènes humains.

«Ancien réservoir de gènes de résistance»


Les virus trouvés dans les échantillons de selles âgés de 700 ans sont liés à des virus connus de nos jours, ce qui suggère que les intestins humains sont restés inchangés après des siècles.

L'une des auteures de l'étude, Christelle Desnues d'Aix Marseille Université en France, affirme que même si les communautés de phages de l'échantillon ancien étaient taxonomiquement différentes de celles des échantillons humains modernes, les fonctions qu'elles exercent semblent être les mêmes.

Elle dit que cela montre comment le tractus gastro-intestinal humain est resté inchangé après tant de siècles, même après les changements de régime et de conditions. Il soutient également la théorie selon laquelle la communauté virale joue un rôle vital dans l'intestin humain et la santé humaine en général - par exemple, dans le cadre du système métabolique humain.

Les recherches de Desneus indiquent que les bactéries intestinales infectant les bactériophages peuvent aider à maintenir cette "bonne" bactérie.

Desneus note que parmi les gènes trouvés dans le phage, elle et son équipe ont trouvé des gènes de résistance aux antibiotiques et des gènes résistants aux composés toxiques, ce qui est une partie normale de la vie.

Elle suggère que les gènes de résistance peuvent protéger les bactéries intestinales des composés toxiques et ajoute:

"Nos preuves démontrent que les bactériophages représentent un ancien réservoir de gènes de résistance et que cela remonte au moins au Moyen Âge."

Elle dit que la raison de leur intérêt pour les virus est "parce que ces cellules sont 100 fois plus abondantes que les cellules humaines dans notre corps, mais leur diversité est encore largement inexplorée."

L’équipe travaille actuellement à de nouvelles études sur les anciens échantillons de matières fécales, qui impliquent les champignons et les parasites qu’ils contiennent. Desnues dit que cela aura des implications pour les microbiologistes, les historiens, les anthropologues et les évolutionnistes.

En 2013, Nouvelles médicales aujourd'hui ont rapporté une étude suggérant qu'un quart de la population avait 40% moins de bactéries intestinales que nécessaire pour rester en bonne santé.

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