Propagation du choléra originaire de la baie du Bengale

Pour retracer la source et expliquer la propagation de la dernière pandémie de choléra (septième), les chercheurs ont utilisé le séquençage de la prochaine génération. Ils ont également souligné l'impact de l'acquisition de la résistance aux antibiotiques sur la formation des épidémies et montrent que la résistance a été obtenue pour la première fois en 1982.
Le type particulier de choléra responsable de la pandémie actuelle peut être attribué à un ancêtre apparu pour la première fois dans la baie du Bengale il y a 40 ans, a révélé le séquençage du génome entier. Le choléra s'est propagé de cet ancêtre à plusieurs reprises dans différentes régions du monde.
Ces découvertes permettent de mieux comprendre les mécanismes à l'origine de la propagation du choléra, une infection diarrhéique normalement liée à des conditions d'hygiène et à des systèmes d'assainissement médiocres et fréquemment rencontrée dans des zones sinistrées telles que le séisme haïtien d'octobre 2010. On estime que le choléra affecte 3-5 millions de personnes chaque année, avec 100 000 à 120 000 décès.
En analysant les génomes de la bactérie responsable Vibrio cholerae prélevés chez 154 patients dans le monde au cours des 40 dernières années, l’équipe a suivi la propagation de l’organisme. Avec la capacité de suivre les changements d'ADN uniques dans le génome de cette souche, les chercheurs ont pu cartographier les voies de transmission de la bactérie, en aidant la planification future de la santé et en rendant possible le retour en arrière de la maladie.
La souche actuelle de la bactérie (souche El Tor) est devenue résistante aux antibiotiques en 1982 en acquérant la région génétique SXT, qui est entrée dans les bactéries à cette époque et qui a généré une transmission mondiale renouvelée à partir de la source originale, ont découvert les chercheurs.
Le Dr Julian Parkhill, chef de groupe au Wellcome Trust Sanger Institute et auteur principal de l'étude, a expliqué:

"En comparant les génomes de 154 cas de choléra, nous avons fait des découvertes importantes sur le développement de la pandémie.
Nos recherches montrent l’importance des événements de transmission mondiaux dans la propagation du choléra. Cela va à l'encontre des croyances antérieures selon lesquelles le choléra provient toujours de souches locales et fournit des informations utiles pour comprendre les épidémies de choléra. "

Les origines de la souche pandémique ont été identifiées de manière cruciale par l’enquête et ses racines il ya quatre décennies dans la baie du Bengale. Depuis lors, il a infecté des individus dans le monde entier, notamment en Afrique, en Asie du Sud et en Amérique du Sud. Nicholas Thomson de l'Institut Sanger et l'un des premiers auteurs de l'enquête a déclaré:

"En regardant les 40 dernières années de transmissions de continent à continent, nous avons constaté que la baie du Bengale sert de réservoir au choléra, où elle peut prospérer et se propager.
En surveillant la propagation de la maladie, nos cartes de transmission pourraient influencer les décisions futures sur la manière de lutter contre cette maladie. "

Ankur Mutreja, premier auteur de l'Institut Sanger, explique que ces découvertes ouvrent de nouvelles voies aux chercheurs qui étudient tous les domaines de l'infection bactérienne: en recherchant comment les changements génétiques permettent aux souches de développer une résistance aux antibiotiques, remonter à ses racines. Ces principaux résultats peuvent être la clé pour débloquer plusieurs autres pandémies bactériennes.
Le professeur G Balakrish Nair, directeur de l'Institut national du choléra et des maladies entériques à Kolkata, en Inde, a déclaré:

"Il s’agit de la première enquête qui fusionne les données d’évolution avec l’émergence de nouvelles variantes contemporaines de Vibrio cholerae, puis utilise les signatures phylogénétiques pour suivre la propagation intercontinentale du choléra.
Ces découvertes nous aideront à comprendre pourquoi les pandémies de choléra commencent en Asie du Sud-Est et se propagent ensuite comme une vague à travers le monde. "

Écrit par Grace Rattue