Google Algorithm trouve des biomarqueurs du cancer

Des chercheurs allemands ont identifié sept protéines qui peuvent aider les médecins à évaluer l'agressivité du cancer chez les patients et à déterminer s'ils devraient ou non recevoir une chimiothérapie.
En utilisant une stratégie similaire à l'algorithme PageRank de Google, les chercheurs de l'université de technologie de Dresde, en Allemagne, ont pu classer environ 20 000 protéines par leur pertinence génétique dans la progression du cancer du pancréas. L'étude est publiée dans PLoS Computational Biology.
L'équipe a utilisé sa propre version de l'algorithme de Google pour identifier de nouveaux biomarqueurs, qui sont des molécules produites par les cellules cancéreuses. Bien que les biomarqueurs puissent aider les médecins à détecter le cancer plus tôt, ils sont souvent difficiles à trouver et prennent du temps. De plus, les biomarqueurs trouvés dans différentes études pour les mêmes types de cancer ne se chevauchent presque jamais.
Cependant, l'équipe a pu éviter ce problème en utilisant la stratégie de Google. Les chercheurs ont utilisé le fait que les protéines d'une cellule sont liées via un réseau d'interactions physiques et régulatrices; la «protéine Facebook» pour ainsi dire.
Christof Winter a expliqué:

"Une fois que nous avons ajouté les informations sur le réseau dans notre analyse, nos biomarqueurs sont devenus plus reproductibles."

À l'aide de l'algorithme de Google et de ces informations sur le réseau, les chercheurs ont constaté un chevauchement considérable avec une étude antérieure de l'Université de Caroline du Nord. Dans ce chevauchement, les chercheurs ont pu identifier une protéine capable d’évaluer l’agressivité dans le cancer du pancréas.
Avant que ces nouveaux biomarqueurs puissent être utilisés en pratique clinique, ils doivent être validés dans une étude de suivi plus large. Cependant, un problème demeure: comment transformer ces informations en nouveaux médicaments qui ralentissent la progression du cancer. Un essai clinique sur un médicament contre le cancer du pancréas est actuellement mené par l'équipe en collaboration avec la société de biotechnologie RESprotect, basée à Dresde.
Écrit par Grace Rattue