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Comment un seul test sanguin pourrait-il identifier l'ensemble de vos antécédents d'infection virale?
Les chercheurs ont créé ce qu'ils disent être un «guichet unique» pour le diagnostic des infections - un test qui permet de déterminer les antécédents viraux complets d'une personne en scannant une seule goutte de sang.
VirScan peut identifier les virus présents et passés dans le sang d'une personne en identifiant les peptides auxquels les anticorps antiviraux se lient.
Le test, appelé VirScan, a été créé par Stephen Elledge et ses collègues du Howard Hughes Medical Institute (HHMI).
"Nous avons mis au point une méthodologie de dépistage permettant de remonter le temps dans les sérums de personnes et de voir quels virus ils ont connus", explique Elledge. "Au lieu de tester un seul virus à la fois, ce qui demande beaucoup de travail, nous pouvons les tester tous en même temps. C'est un guichet unique."
L'équipe explique comment VirScan travaille dans une nouvelle étude publiée dans la revue Science, dans lequel ils révèlent également comment le test a été effectué sur des échantillons de sang de plus de 500 participants infectés par certains virus.
Elledge et ses collègues ont synthétisé plus de 93 000 sections courtes d'ADN pour créer le test, chaque section codant pour différents morceaux de protéines virales, appelées peptides.
L'équipe a ensuite présenté les sections d'ADN aux bactériophages - des virus qui envahissent les cellules bactériennes et les infectent. Chaque bactériophage moulé avec un peptide, le peptide étant présenté à la surface du bactériophage.
Ensemble, les bactériophages présentent toutes les séquences protéiques présentes dans plus de 1 000 souches de virus humains actuellement connues.
Expliquant comment VirScan identifie les virus dans les échantillons de sang, les chercheurs notent que les anticorps antiviraux présents dans le sang reconnaissent des caractéristiques uniques appelées épitopes, qui se trouvent dans les peptides à la surface de chaque bactériophage. Lorsque les bactériophages sont associés à un échantillon de sang, les anticorps dans le sang identifient et se lient à ces épitopes.
Les chercheurs collectent alors ces anticorps et éliminent tout sauf les bactériophages auxquels ils sont attachés.
En effectuant le séquençage de l’ADN sur ces bactériophages, l’équipe est en mesure d’identifier les peptides auxquels les anticorps se sont accrochés, en révélant les virus rencontrés par le système immunitaire d’un individu, qu’il s’agisse d’infection ou de vaccination.
Selon Elledge, il faudra probablement environ 2 à 3 jours à VirScan pour analyser 100 échantillons de sang, mais il est convaincu que ce temps de traitement peut être augmenté à mesure que le test est développé. L'analyse d'un échantillon de sang coûterait environ 25 dollars.
Le test a montré une sensibilité et une spécificité élevées
Les chercheurs ont testé VirScan sur des échantillons de sang de 569 personnes des États-Unis, d'Afrique du Sud, de Thaïlande et du Pérou, tous infectés par certains virus, notamment le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) et l'hépatite C.
Dans l'ensemble, VirScan a analysé environ 100 millions d'interactions possibles entre les anticorps et les épitopes des échantillons de sang, le test produisant des résultats très précis, selon l'équipe. Elledge dit:
"Nous étions dans la plage de sensibilité de 95 à 100% pour [VIH et hépatite C], et la spécificité était bonne - nous n'avons pas identifié à tort les personnes qui étaient négatives. Cela nous a assuré que nous pouvions détecter d'autres virus et quand nous les avons vus, nous saurions qu'ils étaient réels. "
L'équipe a constaté que chaque individu inclus dans l'étude avait en moyenne 10 virus différents, les personnes en Afrique du Sud, au Pérou et en Thaïlande possédant des anticorps contre plus de virus qu'aux États-Unis.
En outre, ils ont constaté que les adultes possédaient des anticorps contre plus de virus que les enfants et que les personnes infectées par le VIH avaient des anticorps contre plus de virus que ceux sans VIH.
La découverte la plus surprenante est peut-être que les réponses en anticorps contre certains virus se sont avérées similaires chez chaque individu; les anticorps de différentes personnes reconnaissaient exactement les mêmes acides aminés présents dans les peptides de virus spécifiques.
Les chercheurs sont convaincus que VirScan pourrait constituer une alternative efficace aux méthodes de test viral existantes, qui permettent de rechercher des virus spécifiques un par un.
Étant donné que le test peut déterminer les antécédents viraux d’une personne, l’équipe estime qu’elle offre le potentiel de découvrir des facteurs qui pourraient avoir été négligés. Le test permet également d’évaluer et de comparer les infections virales chez de grandes populations, et cela peut même avoir des conséquences sur la conception des vaccins.
Leur étude, selon les chercheurs, les a aidés à améliorer la précision de VirScan, et ils espèrent qu’elle s’améliorera encore avec de nouvelles recherches.
L'approche utilisée pour créer VirScan pourrait également être appliquée pour identifier d'autres anticorps, note l'équipe, tels que ceux impliqués dans les maladies auto-immunes, dans lesquelles le système immunitaire attaque les tissus sains de l'organisme.
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