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Des scientifiques cartographient 1 000 outils moléculaires communs aux cellules de l'arbre de vie

Une nouvelle et vaste étude montre que, à travers l'arbre de la vie, des espèces aussi diverses que les vers, les souris, les humains et les anémones partagent un grand nombre des machines à protéines qui aident leurs cellules à fonctionner.
Les chercheurs ont découvert que les assemblages de protéines chez l'homme étaient souvent identiques à ceux d'autres espèces.
Crédit d'image: Jovana Drinkjakovic

La nouvelle étude, impliquant sept groupes de recherche de trois pays et dirigée par des chercheurs de l’Université du Texas (UT) à Austin et de l’Université de Toronto au Canada, est publiée dans la revue. La nature. C'est l'une des recherches les plus importantes et les plus détaillées sur la biologie moléculaire animale jamais entreprise.

Les cellules utilisent des combinaisons complexes de protéines comme outils pour mener à bien des processus essentiels - par exemple, la croissance et la réparation des cellules, le transport et le recyclage des matériaux et la signalisation entre les cellules.

La nouvelle étude cartographie les instructions d'assemblage de près de 1 000 complexes protéiques identiques dans les cellules d'espèces représentant une large section du règne animal, révélant leur évolution partagée.

L'un des auteurs principaux, Edward Marcotte, professeur de biosciences moléculaires à l'UT Austin, a déclaré:

"Essentiellement, nous avons pu construire une sorte de diagramme d'assemblage sur la manière dont des milliers de protéines différentes se rassemblent pour remplir leur rôle à l'intérieur des cellules de la plupart des animaux."

Le professeur Marcotte et ses collègues ont utilisé des techniques comme la spectrométrie de masse à haut débit pour analyser les protéines cellulaires d'organismes allant de la moisissure visqueuse, de la levure, des vers, des oursins et des anémones aux mouches, grenouilles, souris et humains.

Ils ont ensuite croisé les données de spectrométrie de masse avec des informations déjà connues sur les génomes de ces espèces.

De nombreux assemblages de protéines chez l'homme identiques à d'autres espèces

La carte détaille également le réseau d'interactions protéine-protéine qui se produit lorsque les protéines sont réunies pour former les complexes.

Par exemple, cela montre qu'une protéine dont nous ne connaissons pas encore le rôle est susceptible d'être impliquée dans la fixation de dommages dans une cellule si celle-ci colle aux protéines connues du «bricoleur».

C'est comme trouver le manuel d'instruction pour fabriquer différents jouets de transformateur à partir des composants de base, et pas seulement cela, mais aussi comment assembler des transformateurs pour en faire de plus gros.

Les chercheurs ont également découvert que les assemblages de protéines chez l'homme étaient souvent identiques à ceux d'autres espèces. Par exemple, ils ont découvert que les cellules utilisent des complexes protéiques identiques pour former la tête et l'?il entre les différentes espèces.

Le co-auteur principal Andrew Emili, professeur de génétique moléculaire à Toronto, affirme que le point culminant de l’étude est son ampleur:

«Nous avons triplé le nombre d’interactions protéiques connues pour chaque espèce. Ainsi, sur tous les animaux, nous pouvons maintenant prédire, avec une grande confiance, plus d’un million d’interactions protéiques, ce qui constitue un grand pas en avant. réseaux d'interactions protéiques. "

Si même l'une de ces interactions est perturbée ou perdue, cela peut entraîner une maladie. Ainsi, la carte - qui sera accessible aux chercheurs du monde entier par le biais de bases de données en libre accès - sera un outil puissant pour étudier les causes de maladies telles que la maladie d’Alzheimer, la maladie de Parkinson et le cancer.

Les résultats révèlent également que des dizaines de milliers d'interactions protéiques n'ont pas changé depuis l'apparition de la première cellule ancestrale, il y a un milliard d'années - précédant toute la vie animale sur Terre.

Le professeur Marcotte résume la valeur des nouvelles données:

"Cela renforce non seulement ce que nous savons déjà de notre ascendance évolutive commune, mais cela a également des implications pratiques, en permettant d'étudier la base génétique d'une grande variété de maladies et la manière dont elles se présentent chez différentes espèces."

Pendant ce temps, Nouvelles médicales aujourd'hui ont récemment appris que les scientifiques ont également cartographié l'activité génétique des premiers jours d'un embryon humain. L'étude, publiée dans Communications Nature et dirigé par le Karolinska Institutet en Suède, devrait déboucher sur de nouvelles pistes de recherche et des traitements pour l'infertilité et d'autres maladies.

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