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Etude du séquençage génétique limité en tant que prédicteur de la maladie

Si les tendances actuelles se poursuivent, le coût de l'analyse de son génome sera comparable à celui de la facture hebdomadaire des supermarchés. Mais cela nous donnera-t-il la capacité de prédire quelles maladies communes sont susceptibles de nous toucher dans le futur? Eh bien, selon une nouvelle étude de jumeaux qui a été publiée cette semaine dans Médecine translationnelle des sciences, la réponse dans la plupart des cas est susceptible d'être non.
En fait, les chercheurs de Johns Hopkins mettent en garde contre la complaisance, en particulier en ce qui concerne les résultats négatifs; ils pourraient par inadvertance donner aux gens un faux sentiment de sécurité.
En effet, si un test positif pour une variante génique connue pour causer une maladie signifie que vous pourriez être en mesure de prédire le risque plus élevé de développer la maladie, un test négatif ne signifie pas qu'il n'y a pas de risque. C'est notamment le cas de nombreux cancers, ont déclaré les chercheurs.
Le co-auteur, le Dr Kenneth Kinzler, a cité l'exemple du cancer de l'ovaire, l'une des maladies analysées dans l'étude.
Kinzler, co-directeur du Ludwig Center de Johns Hopkins et professeur d'oncologie, a déclaré dans un communiqué:
"Jusqu'à deux pour cent des femmes subissant un séquençage du génome entier pourraient recevoir un résultat positif pour le cancer de l'ovaire, les avertissant qu'elles ont au moins une chance sur dix de développer ce cancer au cours de leur vie."
"Les 98% restants de femmes qui subissent un test négatif pour le cancer de l'ovaire ne se verront pas garantir une vie sans cancer de l'ovaire car leur risque de le développer est très similaire à celui de la population générale", a-t-il ajouté.
"Ainsi, un test négatif n'est pas un" laissez-passer gratuit "pour écarter la possibilité d'acquérir une maladie particulière."
La technologie du séquençage du génome entier permet aux scientifiques de cataloguer tous les gènes dont un individu hérite, y compris les variants de chaque parent.
En moyenne, si vous compariez le génome de deux individus, en utilisant cette technologie, vous trouveriez 4,5 millions de différences dispersées dans leurs cartes d’ADN.
La technologie vous permettrait d'identifier ces différences et de les relier à des risques connus ou suspectés de développer certaines maladies.
Pour l'étude, les chercheurs ont analysé des données sur des milliers de jumeaux identiques enregistrés dans des registres en Suède, au Danemark, en Finlande, en Norvège et dans le registre national de recherche des jumeaux vétérans de la Seconde Guerre mondiale de la National Academy of Science.
Les jumeaux identiques ont le même génome: ils héritent de la même variante de chaque gène de leurs parents. Donc, si le génome était le facteur déterminant des maladies courantes, vous devriez pouvoir utiliser la prévalence de la maladie chez un jumeau pour déterminer dans quelle mesure le séquençage du génome pourrait prédire le risque de développement de la maladie dans l'autre.
À l'aide de modèles mathématiques mis au point à Johns Hopkins et au Dana-Farber Cancer Institute, les chercheurs ont analysé l'incidence de 24 maladies parmi les paires de jumeaux étudiés. Celles-ci incluaient les cancers, les maladies auto-immunes, génito-urinaires, neurologiques, cardiovasculaires et l'obésité.
Les modèles ont calculé la capacité du séquençage du génome entier à prédire le risque de chaque maladie en fonction des seuils typiques utilisés par les médecins pour commencer des traitements préventifs ou thérapeutiques.
Et ce que les chercheurs ont découvert, c’est que le séquençage du génome entier pourrait, grâce à un résultat positif, avertir les gens d’un risque accru d’au moins une maladie, mais que la plupart des personnes étudiées ce qu'ils pourraient développer plus tard dans la vie.
Les chercheurs suggèrent que leurs résultats mettent en doute le fait que le séquençage du génome entier puisse prédire de manière fiable la plupart des maladies que la plupart des personnes qui prendront de tels tests sont susceptibles de développer.
Le co-auteur, le Dr Bert Vogelstein, a déclaré:
"Nous pensons que les tests génomiques ne remplaceront pas les stratégies actuelles de prévention des maladies."
Vogelstein, professeur d’oncologie à Clayton au Johns Hopkins Kimmel Cancer Center, co-directeur du Ludwig Center for Cancer Genetics et chercheur au Howard Hughes Medical Institute, suggère que la clé pour réduire les taux de mortalité liés aux maladies sera :
"Des stratégies de dépistage, de diagnostic précoce et de prévention prudentes, telles que ne pas fumer et éliminer les cancers précoces."
Lui et ses collègues concluent que le séquençage du génome entier est susceptible de renseigner sur la prédiction du cancer uniquement chez les personnes ayant des antécédents familiaux importants de la maladie.
"Dans les familles ayant des antécédents de cancer, le séquençage du génome entier peut être très instructif pour identifier les gènes hérités qui augmentent le risque de cancer", explique le co-auteur, le Dr Victor Velculescu, professeur d'oncologie chez Johns Hopkins. des premières preuves que le séquençage du génome entier peut identifier des gènes de cancer du pancréas héréditaires dans les familles.
"Mais les cancers héréditaires sont rares. La plupart des cancers résultent de mutations acquises lors d'expositions environnementales, de choix de mode de vie et d'erreurs aléatoires dans les gènes qui se produisent lorsque les cellules se divisent", at-il ajouté.
Cependant, pour quatre des maladies non cancéreuses étudiées, les chercheurs ont conclu que les tests génétiques pourraient, en théorie, identifier plus des trois quarts des personnes susceptibles de les développer à l’avenir: il s’agit des maladies coronariennes chez l’homme, de l’auto-immunité thyroïdienne, diabète de type 1 et maladie d'Alzheimer.
Écrit par Catharine Paddock PhD

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