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Les empreintes génétiques suivent les parasites du paludisme résistants aux médicaments
Nouvelles souches résistantes à l'artémisinine du parasite responsable du paludisme Plasmodium falciparum se répandent rapidement au Cambodge, selon un groupe international de scientifiques, dans un document de recherche qui révèle également comment les souches pharmacorésistantes peuvent être identifiées à partir de leurs empreintes génétiques.
L'auteur principal, Dominic Kwiatkowski, de l'Université d'Oxford et du Wellcome Trust Sanger Institute, près de Cambridge, et ses collègues ont découvert les nouvelles souches résistantes à l'artémisinine dans l'ouest du Cambodge, un centre de résistance aux médicaments connu. Ils écrivent à ce sujet, et comment ils ont pu identifier des modèles génétiques distincts pour chacune des souches, dans le numéro en ligne du 28 avril de Génétique de la nature.
L’artémisinine est le médicament clé contre le paludisme, qui est causé lorsque le parasite P. falciparum pénètre dans la circulation sanguine par une piqûre de moustique. Toutefois, selon l’Organisation mondiale de la santé (OMS), l’apparition de souches du parasite résistantes aux médicaments affaiblit l’impact de l’artémisinine, mettant des centaines de milliers de vies en danger.
Le co-auteur Nicholas White, professeur au Centre de médecine tropicale de l'Université d'Oxford, a déclaré dans un communiqué:
"La résistance à l'artémisinine est une urgence qui pourrait faire échouer tout le bon travail de lutte contre le paludisme au cours des dernières années. Nous avons désespérément besoin de méthodes pour la suivre afin de la contenir, et les empreintes moléculaires le fournissent."
En utilisant les nouvelles technologies de séquençage du génome, le groupe international a séquencé l’ADN complet de 825 P. falciparum des échantillons provenant d'Asie du Sud-Est et d'Afrique et ont trouvé un "schéma inhabituel de la structure de la population parasitaire à l'épicentre de la résistance à l'artémisinine dans l'ouest du Cambodge".
Les technologies leur ont permis de choisir des modèles génétiques ou «empreintes digitales» pour chacune des souches résistantes à l'artémisinine.
Kwiatkowski dit à la presse:
"Notre étude de la variation génétique a montré que les parasites du paludisme du Cambodge occidental avaient une structure de population remarquablement différente de celle des autres pays analysés."
"Différent non seulement des pays d’Afrique, mais aussi des populations de parasites du paludisme en Thaïlande, au Vietnam et même dans l’est du Cambodge", ajoute-t-il.
Les résultats donnent également des indications importantes sur la manière dont la résistance émerge et persiste chez certaines populations de parasites.
Les chercheurs suggèrent que leur approche offre un nouveau moyen utile de détecter et de suivre l’émergence mondiale de la résistance aux médicaments. Un avantage important, par exemple, est que vous n'avez pas à connaître les causes génétiques de la résistance aux médicaments pour identifier les souches résistantes.
Cela compte comme une étape importante vers la surveillance et les efforts pour éliminer le paludisme dans le monde entier. Les autorités sanitaires ont besoin d'outils rapides et efficaces pour détecter génétiquement les parasites résistants aux médicaments afin de suivre leur émergence et leur propagation.
Dans leur article, les auteurs montrent que l'application de leurs techniques permettrait aux autorités de surveiller en temps réel la propagation et l'évolution des parasites résistants aux médicaments.
Au début, le groupe pensait simplement trouver des anomalies. Mais des recherches plus poussées ont révélé trois populations distinctes de parasites résistants à l'artémisinine, qui différaient non seulement des autres populations encore sensibles au médicament, mais également des autres.
"C'est comme s'il y avait différents groupes ethniques de parasites résistants à l'artémisinine dans la même région", explique Kwiatkowski.
Les résultats offrent également de nouveaux indices sur la raison pour laquelle l’ouest du Cambodge est un point névralgique pour l’apparition de parasites du paludisme résistants aux médicaments, ce qui intrigue les chercheurs depuis un certain temps. La résistance à d'autres médicaments antipaludiques, la chloroquine et la sulfadoxine / pyriméthamine, a commencé en Asie du Sud-Est et s'est étendue à l'Afrique.
En fournissant également ce que les chercheurs décrivent comme "un cadre génétique au niveau de la population pour étudier les origines biologiques de la résistance à l'artémisinine", ils estiment que leurs résultats permettent également de "définir des marqueurs moléculaires pour faciliter son élimination".
White, qui travaille également à l'Unité de recherche en médecine tropicale Mahidol-Oxford de l'Université Mahidol, à Bangkok, en Thaïlande, a déclaré:
"Bien que nous n'ayons pas encore identifié le mécanisme d'action précis ou la résistance à l'artémisinine, cette recherche représente un progrès substantiel dans cette direction."
Dans son rapport sur le paludisme dans le monde 2012, l'OMS suggère que les progrès considérables réalisés dans la lutte contre le paludisme au cours de la dernière décennie pourraient être interrompus en raison du manque d'argent.
Écrit par Catharine Paddock PhD
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