La séquence du génome du cancer du sang incurable offre des lueurs pour la thérapie

Un séquençage massif sans précédent du génome de multiples tumeurs du myélome de 38 personnes a permis de découvrir des gènes et des voies auparavant insoupçonnés qui pourraient donner l’espoir de développer des médicaments plus efficaces pour traiter ce cancer du sang incurable.
Bien que la cartographie des gènes de tant de personnes offre le plus d’indices sur ce qui pourrait conduire au développement de ce cancer, les chercheurs soulignent qu’il ya encore beaucoup de travail à faire avant de savoir quels gènes pourraient constituer des cibles médicamenteuses utiles.
Vous pouvez lire sur leur travail dans un article publié en ligne cette semaine dans la revue La nature.
Le premier auteur, le Dr Michael Chapman, un hématologue travaillant avec le Eli and Edythe L Broad Institute de Cambridge, aux États-Unis, qui travaille également au Addenbrooke's Hospital dans un autre Cambridge au Royaume-Uni, a déclaré:
"Nous avons découvert des gènes qui n’avaient pas été suspectés dans le cancer."
"Nous avons défini des voies entièrement nouvelles comme étant importantes dans le cancer", a-t-il ajouté.
En plus de découvrir de nouvelles voies - réactions chimiques interdépendantes qui entraînent des changements dans les cellules -, Chapman et ses collègues ont découvert des mutations génétiques inconnues auparavant, qui, espèrent-ils, donneront beaucoup de place à de nouvelles recherches sur le myélome multiple.
Le co-auteur Dr Todd Golub, directeur du Broad's Cancer Program et de Charles A Dana Investigator en génétique du cancer humain au Dana-Farber Cancer Institute de Boston, Massachusetts, a déclaré que l'étude était un bon exemple de "comment l'analyse génétique peut aider le champ dans la bonne direction très dramatiquement "; mais il a également insisté sur le fait qu'il restait encore beaucoup à faire avant de pouvoir identifier de nouvelles cibles thérapeutiques utiles.
L'étude de recherche a également été couronnée de succès par d'autres moyens. De nombreux processus qui sont maintenant standard dans l'analyse du génome du cancer ont été mis au point dans ce projet, a déclaré Golub.
Le myélome multiple est un cancer du sang incurable de cause inconnue qui commence dans la moelle osseuse, provoquant une malignité des plasmocytes, à la suite de quoi ils envahissent les cellules normales et attaquent les os solides. C'est le deuxième cancer du sang le plus répandu aux États-Unis, où environ 20 000 Américains sont diagnostiqués chaque année.
Nous savons peu de choses sur les causes du myélome multiple: elles peuvent survenir chez des personnes sans facteurs de risque connus et sans antécédents familiaux de la maladie.
Les chances de survivre plus de cinq ans après le diagnostic sont inférieures à 40%, ce qui est faible par rapport à ce que l'on peut attendre d'autres types de cancer.
Pour leur étude, les chercheurs ont mené un "séquençage massivement parallèle" des génomes tumoraux de 38 patients "et leur comparaison avec des ADN normaux correspondants".
En séquençant tant de génomes de personnes, ils ont pu déterminer quels gènes étaient mutés de manière significative et récurrente d’une manière qui n’aurait pas été possible avec un seul génome, a déclaré Chapman, dont le travail est parrainé par une bourse de recherche en leucémie et lymphome. .
Le séquençage en parallèle a révélé des voies jusque-là inconnues, notamment des mutations dans les gènes impliqués dans le traitement de l'ARN et la traduction des protéines (près de la moitié des patients), la méthylation des histones. gènes impliqués dans la coagulation sanguine.
Deux des gènes, DIS3 et FAM46C, semblent jouer un rôle important dans la stabilité de l'ARN et sa capacité à se transformer en protéines. D'autres études devraient maintenant étudier exactement le rôle qu'ils jouent dans le cancer et comment ils peuvent être utiles en tant que cibles de traitement.
Golub, qui est également chercheur au Howard Hughes Medical Institute et professeur de pédiatrie à la faculté de médecine de Harvard, a déclaré que ces gènes, qui étaient fréquemment mutés, «n’étaient sur aucun radar avant de penser spécifiquement au myélome multiple ou au cancer en général».
"Cela montre qu'il y a de nouveaux gènes causant le cancer qui vont être découverts grâce à ces efforts de séquençage", a-t-il ajouté.
Une découverte qui pourrait initier des possibilités de traitement plus tôt est la découverte de mutations dans le gène BRAF chez un plus petit nombre de patients atteints de myélome multiple.
Une autre étude a montré que des échantillons de 4% de 150 patients atteints de myélome multiple présentaient des mutations BRAF.
Les mutations BRAF n'ont jamais été associées à un myélome multiple, bien qu'elles soient impliquées dans d'autres cancers tels que le mélanome et le cancer du côlon. Les médicaments qui ciblent ce gène montrent déjà des résultats prometteurs chez les patients atteints de mélanome et, avec d'autres études, il ne faudra peut-être pas autant de temps que les autres découvertes pour déterminer si le ciblage du BRAF est aussi efficace contre le myélome multiple.
Une voie suggérée par l'étude est la voie NF-?B qui, si elle est activée au mauvais moment, active les gènes qui permettent aux cellules cancéreuses de croître et de se diviser sans contrôle. La voie est apparue dans des études antérieures sur le myélome multiple, mais sans savoir quels événements l'avaient activée.
Chapman et ses collègues ont trouvé 11 gènes dans cette voie qui ont été altérés dans au moins un des échantillons tumoraux.
Bien que les gènes en eux-mêmes ne soient pas mutés à un rythme élevé, en examinant les voies qui les relient, il y a une plus grande chance de trouver les événements responsables du cancer, a déclaré le Dr Gad Getz, directeur de l'analyse du génome du cancer. au Broad Institute.
Chapman attribue une grande partie du succès du projet à l'étroite collaboration entre les chercheurs sur le cancer et les experts en informatique, ce qui leur a permis de «trouver des choses qui n'auraient jamais été découvertes par des moyens traditionnels ou en séquençant des génomes uniques».
Toutes les données du projet sont mises à la disposition des chercheurs sur le cancer du monde entier.
Le financement de la recherche provient de la Fondation de recherche sur le myélome multiple et des échantillons de tissus proviennent de la banque de tissus du Consortium de recherche sur le myélome multiple.
"Séquençage initial du génome et analyse du myélome multiple."
Michael A. Chapman, Michael S. Lawrence, Jonathan J. Keats, Kristian Cibulskis, Carrie Sougnez, Anna C. Schinzel, Christina L. Harview, Jean-Philippe Brunet, Gregory J. Ahmann, Mazhar Adli, et al.
La nature 471, 467-472, publié en ligne le 23 mars 2011.
DOI: 10.1038 / nature09837
Source supplémentaire: Broad Institute (23 mars 2011).
Rédigé par: Catharine Paddock, PhD

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