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Un traitement antibiotique perturbe le microbiome intestinal pendant un an

Une étude publiée dans la publication publiée dans le journal indique qu’un seul cycle d’antibiotiques suffit à perturber la constitution normale des micro-organismes intestinaux pendant un an, ce qui pourrait mener à une résistance aux antibiotiques. mbio.
Les antibiotiques sont de plus en plus incapables de combattre les bactéries lorsque la résistance se développe.

Depuis 70 ans, les agents antimicrobiens, connus sous le nom d'antibiotiques, luttent avec succès contre les maladies infectieuses, réduisant considérablement les taux de morbidité et de mortalité dans le monde.

Cependant, leur utilisation généralisée a conduit à des adaptations des organismes infectieux qu'ils sont conçus pour tuer, réduisant ainsi l'efficacité des médicaments.

Aux États-Unis, les bactéries résistantes aux antibiotiques provoquent au moins 2 millions de cas de maladie et 23 000 décès par an.

En conséquence, les Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC) ont défini les 18 principales menaces de résistance aux États-Unis et les ont classées en fonction du niveau de préoccupation: urgent, grave ou préoccupant. Les professionnels de la santé ont été encouragés à limiter l'utilisation des antibiotiques.

Ceux de la catégorie "urgent" sont actuellement:

  • Clostridium difficile (C. difficile), qui provoque une diarrhée mortelle
  • Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes (CRE), présentes principalement dans les établissements médicaux, où elles provoquent des infections sanguines fatales dans près de 50% des cas
  • Neisseria gonorrhoeae qui causent la gonorrhée, une maladie sexuellement transmissible, touchant 820 000 personnes par an.

L'étude en cours, dirigée par Egija Zaura, Ph.D., professeure agrégée en écologie microbienne orale au Centre universitaire de dentisterie d'Amsterdam, aux Pays-Bas, a examiné 66 adultes sains du Royaume-Uni et de Suède auxquels différents antibiotiques ont été prescrits.

Les participants ont été répartis au hasard pour recevoir un traitement complet à l'un des quatre antibiotiques suivants: ciprofloxacine, clindamycine, amoxicilline ou minocycline ou un placebo.

Les chercheurs ont prélevé des échantillons de selles et de salive sur les participants au début de l'étude, immédiatement après avoir pris les antibiotiques, et 1, 2, 4 et 12 mois après la fin du cours.

Un seul cours d'antibiotique a un impact à long terme

Une technique de laboratoire appelée séquençage de l’amplicon du gène de l’ARNr 16S a identifié la présence de bactéries sur 389 échantillons de selles et 391 échantillons de salive.

Une autre technique de laboratoire, le séquençage métagénomique, a mis en évidence les plus grandes différences avant et après l’utilisation des antibiotiques, ce qui a permis aux chercheurs d’étudier l’émergence d’une résistance aux antibiotiques.

Les médicaments se sont avérés enrichir les gènes associés à la résistance aux antibiotiques et affecter gravement la diversité microbienne dans l'intestin pendant des mois après l'exposition. En revanche, les micro-organismes présents dans la salive ont montré des signes de récupération en quelques semaines seulement.

Les micro-organismes présents dans les fèces des participants ont été sévèrement affectés par la plupart des antibiotiques pendant des mois. En particulier, les chercheurs ont constaté une diminution de l'abondance des espèces associées à la santé qui produisent du butyrate, une substance qui inhibe l'inflammation, la formation de cancers et le stress dans l'intestin.

La diversité du microbiome dans les fèces était significativement réduite pendant 4 mois chez les participants prenant de la clindamycine et jusqu'à 12 mois chez ceux prenant de la ciprofloxacine. En revanche, la diversité dans le microbiome de la cavité buccale n’a été modifiée que jusqu’à une semaine après l’exposition au médicament.

L'amoxicilline n'a eu aucun effet significatif sur la diversité du microbiome dans l'intestin ou la cavité buccale, mais elle était associée au plus grand nombre de gènes résistants aux antibiotiques.

"Les antibiotiques ne doivent être utilisés que lorsque cela est vraiment nécessaire"

Les chercheurs ne sont pas sûrs de la raison pour laquelle la cavité buccale redevient normale plus tôt que l'intestin, mais cela pourrait être dû au fait que l'intestin est exposé à une plus longue période d'antibiotiques.

Alternativement, la cavité buccale peut être intrinsèquement plus résistante au stress car elle est exposée à différents facteurs de stress chaque jour.

Les participants britanniques ont commencé l'étude avec une plus grande résistance aux antibiotiques que ceux de Suède, probablement en raison d'attitudes différentes vis-à-vis des antibiotiques. La Suède a connu une baisse significative de l'utilisation des antibiotiques au cours des deux dernières décennies.

Zaura dit:

"Les antibiotiques ne doivent être utilisés que lorsque cela est vraiment nécessaire. Même un seul traitement antibiotique chez les personnes en bonne santé contribue au risque de développement de résistance et entraîne des changements néfastes à long terme dans le microbiome intestinal. hors de question. Mais il y a des situations où nous ne devrions pas les utiliser, comme lorsqu'il n'y a pas de raisons fondées sur des preuves. "

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