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L'outil cartographie l'origine du cancer à l'aide de signatures biologiques

Des chercheurs de l’université de Stanford, en Californie, ont entrepris de mettre au point un outil permettant de déterminer l’origine de certains types de cancer à partir de la signature biologique de leurs cellules mutées. Ils croient que l'outil aidera les médecins à choisir les meilleurs traitements pour leurs patients.

L’équipe interdisciplinaire de chimistes, d’oncologues et d’un statisticien décrit comment elle a créé et testé cet outil sur un gène du cancer lié au lymphome Actes de l'Académie nationale des sciences.

L'auteur principal, la Dre Livia Eberlin, chercheuse postdoctorale en chimie, affirme que l'outil est plus qu'un diagnostic: "Il fournit des informations supplémentaires qui pourraient être pronostiques".

Elle explique que si différents gènes peuvent donner lieu au même cancer, dans certains cas, l'agressivité et le type de traitement dépendront du gène du cancer, appelé oncogène, qui l'a déclenché en premier lieu.

L'équipe a étudié un gène du cancer connu pour déclencher la moitié de tous les cancers chez l'homme

Un oncogène est un gène normal qui a muté - son ADN a été perturbé d'une manière ou d'une autre - entraînant un dysfonctionnement des cellules et un cancer.


Un oncogène est un gène normal qui a muté, provoquant un dysfonctionnement des cellules et un cancer.

Pour leur étude, le Dr Eberlin et ses collègues ont décidé d'étudier MYC, un oncogène associé au lymphome et connu pour déclencher environ la moitié de tous les cancers chez l'homme.

L'oncogène est connu pour réguler de nombreuses fonctions biologiques dans les cellules cancéreuses - dont le métabolisme du glucose et de la glutamine, comme l'explique le co-auteur Richard Zare, professeur de chimie et conseiller du Dr Eberlin:

"Lorsque le cancer survient, la cellule adore engloutir le glucose - qui est un sucre - et la glutamine. Elle les absorbe et produit différents lipides - des molécules de graisse différentes de celles qu’elle produit normalement."

Les chercheurs ont utilisé une combinaison d’outils statistiques sophistiqués et «d’imagerie par spectrométrie de masse à ionisation par électrospray à désorption (DESI-MSI)» pour étudier les changements dans les molécules grasses dans les lymphomes induits par le MYC.

Un nouvel outil a retracé 86 molécules grasses au gène du cancer

En utilisant la nouvelle méthode, ils ont réussi à retracer non pas un, mais 86 lipides ou lipides dans l'oncogène.

En utilisant ensuite des échantillons de lymphome humain avec des taux d'expression variables d'oncoprotéine MYC, ils ont montré que les lymphomes avec une expression élevée de MYC avaient un profil lipidique distinct de ceux ayant une faible expression.

Ils ont également constaté que les profils lipidiques des échantillons de lymphome humain contenaient de nombreux lipides qui étaient également significatifs dans les lymphomes animaux induits par le MYC.

Les chercheurs affirment que l’étape suivante consistera à déterminer quel est le mécanisme causal - alors que nous avons maintenant une image beaucoup plus claire du lien entre les cellules cancéreuses et leur origine, le véritable déclencheur biologique qui fait progresser le cancer est encore mystère.

Pendant ce temps, Nouvelles médicales aujourd'hui récemment rapporté comment une équipe au Royaume-Uni a découvert comment cartographier l'histoire de l'ADN d'une cellule à son origine embryonnaire. En examinant le nombre et le type de mutations dans l’ADN d’une cellule, l’équipe a découvert qu’elle pouvait détecter les empreintes ou «signatures» des dommages à l’ADN subis par la cellule au cours de la vie de l’organisme.

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