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Nouveau gène de résistance aux antibiotiques qui dépasse la «dernière ligne de défense» trouvée en Chine
Une nouvelle étude publiée dans le journal Un nouveau gène qui rend les bactéries résistantes aux polymyxines - les antibiotiques de dernier recours pour traiter les infections - est répandue dans une grande famille de bactéries prélevées sur des porcs et des personnes en Chine méridionale. The Lancet Infectious Diseases.
Les chercheurs ont d’abord trouvé des preuves de la résistance transférable à la colistine, un médicament à base de polymyxine, chez des bactéries isolées chez un porc vivant dans une ferme intensive en Chine.
Les chercheurs disent que certaines des souches bactériennes qui ont acquis le nouveau gène de résistance - appelé MCR-1 - ont également un potentiel épidémique.
La découverte est particulièrement alarmante car les chercheurs ont trouvé le nouveau gène sur les plasmides - une forme d'ADN mobile qui se partage et se propage facilement entre les différentes bactéries via le transfert horizontal des gènes.
Cela fait écho à une découverte antérieure en Inde, il y a quelques années, du gène de résistance NDM-1 qui rend les bactéries résistantes à presque tous les antibiotiques, y compris les antibiotiques de dernier recours, les carbapénèmes.
Dans leur étude, les chercheurs, dirigés par des membres de la South China Agricultural University, à Guangzhou, concluent:
"L'émergence de la MCR-1 annonce la rupture du dernier groupe d'antibiotiques, les polymyxines, par une résistance à médiation plasmidique. Bien qu'elle soit actuellement limitée à la Chine, la MCR-1 imitera probablement d'autres mécanismes de résistance tels que NDM-1."
Le co-auteur Jian-Hua Liu, professeur spécialisé dans la résistance aux antimicrobiens chez les animaux, affirme que les résultats sont "extrêmement préoccupants" car les polymyxines étaient "la dernière classe d'antibiotiques dans laquelle la résistance était incapable de se propager".
La résistance à la polymyxine se transfère facilement parmi les bactéries courantes
La résistance à la polymyxine est connue pour se propager via des mutations chromosomiques mais n’a jamais été signalée par transfert de gène horizontal auparavant. Lorsqu'il s'est limité à des mutations chromosomiques, le mécanisme de résistance était «instable et incapable de se propager à d'autres bactéries», explique le professeur Liu.
L’équipe a trouvé des preuves que le gène passe facilement entre des bactéries communes telles que Escherichia coli qui causent de nombreux types d’infection tels que les voies urinaires, et Klebsiella pneumoniae qui causent la pneumonie et d'autres infections.
Selon le professeur Liu, "la progression de la résistance aux médicaments à la résistance aux pandrug est inévitable".
L’étude a commencé lorsque l’équipe a trouvé des preuves de la résistance transférable à la colistine, un médicament à base de polymyxine, dans une souche de E. coli isolé d'un cochon dans une ferme intensive à Shanghai. Ils ont découvert que la résistance pouvait être transférée à une autre souche.
Les chercheurs ont ensuite analysé les bactéries prélevées chez les porcs dans les abattoirs et chez les porcs et les poulets crus vendus à Guangzhou entre 2011 et 2014. Ils ont également analysé des échantillons de patients dans deux hôpitaux des provinces du Guangdong et du Zhejiang.
Ils ont trouvé que le gène MCR-1 était présent dans 166 des 804 échantillons de E. coli provenant d'animaux et 78 des 523 échantillons de viande crue. Ils l'ont également trouvé dans 16 échantillons de E. coli et K. pneumoniae pris sur 1 322 patients hospitalisés.
L’équipe était particulièrement préoccupée par le taux élevé de copie et de transfert du gène MCR-1 E. coli souches et que la proportion d'échantillons positifs a augmenté d'année en année.
Les chercheurs suggèrent dans leur article qu '"il est probable que la résistance à la colistine médiée par MCR-1 soit apparue chez les animaux et s'est ensuite propagée aux humains".
L’équipe a également constaté que le gène est capable de se propager à d’autres bactéries à potentiel épidémique, notamment Pseudomonas aeruginosa, qui peut causer des infections graves chez les patients hospitalisés et chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli.
"Limiter ou arrêter d'utiliser des polymixines en agriculture"
La Chine est un gros utilisateur et producteur de colistine et le principal moteur de la demande mondiale croissante d'antibiotiques, qui devrait dépasser 13 000 tonnes par an d'ici la fin de 2015 et augmenter de 4,75% par an.
Le gouvernement chinois a lancé une évaluation des risques liés à l'utilisation de la colistine dans les aliments pour animaux et travaille avec une partie de l'équipe pour évaluer l'impact de la MCR-1.
Cependant, les auteurs notent que la Chine n'est pas le seul utilisateur de colistine dans l'agriculture. De nombreux autres pays, dont certains en Europe, utilisent également des polymixines dans l'agriculture. La responsabilité d'accepter et de résoudre le problème est donc mondiale.
Dans un commentaire d'accompagnement, David Paterson et Patrick Harris, de l'Université du Queensland à Brisbane, en Australie, affirment que le lien entre l'utilisation de la colistine à la ferme et la résistance chez les animaux, les aliments et les êtres humains est maintenant complet. Une façon de rompre le lien, notent-ils, est de limiter ou d'arrêter l'utilisation de l'antibiotique en agriculture et:
"Cela nécessitera une volonté politique substantielle et nous appelons les dirigeants chinois à agir rapidement et de manière décisive. Sinon, cela créera un problème de santé publique de dimensions majeures."
En vedette sur le problème croissant de la résistance aux antibiotiques, Nouvelles médicales aujourd'hui examine comment il est devenu une menace mondiale pour la santé publique qui nous propulse vers une «ère post-antibiotique».
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