Le génome entier de la peste noire est séquencé

Selon un article publié aujourd'hui dans le journal américain, le génome entier de la peste noire, l'une des épidémies les plus vicieuses de l'histoire de l'humanité, a été séquencé par des scientifiques du Canada, de l'Allemagne et des États-Unis. La nature. Ils l'appellent l'ancêtre de toutes les plaies modernes, et ajoutent que c'est la première fois que quelqu'un est capable de rédiger un génome reconstruit de n'importe quel agent pathogène précoce.
Les auteurs disent qu'ils seront maintenant en mesure de suivre l'évolution de l'agent pathogène et si et comment sa virulence a évolué avec le temps. Leur étude a jeté les bases d'une compréhension plus approfondie des maladies infectieuses aujourd'hui.
Dans une étude récemment publiée, la même équipe explique comment ils ont réussi à extraire de minuscules fragments d'ADN dégradé de l'agent à l'origine de la peste noire, et ont démontré qu'une certaine variante du Yersinia pestis C'est la bactérie qui a causé la peste qui a détruit 50 millions de personnes en Europe entre 1347 et 1351.

Yersinia pestis, une variante de cette bactérie, a causé la peste noire qui a tué 50 millions d'Européens
Le généticien Hendrik Poinar, de l’Université McMaster, au Canada, a expliqué que la prochaine étape consistait à essayer de "Capturer" et séquencer le génome entier.
Poinar a dit:

"Les données génomiques montrent que cette souche bactérienne, ou variante, est l’ancêtre de tous les fléaux modernes que nous avons aujourd’hui dans le monde. Toutes les épidémies à travers le monde proviennent d’un descendant de la peste médiévale. Avec une meilleure compréhension de l’évolution de cette maladie mortelle. pathogène, nous entrons dans une nouvelle ère de recherche sur les maladies infectieuses. "

Johannes Krause, de l'Université de Tubingen, en Allemagne, a déclaré:

"En utilisant la même méthodologie, il devrait maintenant être possible d'étudier les génomes de toutes sortes de pathogènes historiques", a déclaré Krause, l'un des principaux auteurs de l'étude. "Cela nous donnera un aperçu direct de l'évolution des agents pathogènes humains et des pandémies historiques."

Les pathogènes d'aujourd'hui, qui tuent environ 2 000 personnes par an, sont des descendants directs de la même peste bubonique.
Peste bubonique est une maladie zoonotique - elle peut être transmise des animaux aux humains - qui circule principalement parmi les petits rongeurs et les puces qui les infestent. C'est l'un des trois types d'infections causées par Yersinia pestis. La peste bubonique tue environ deux personnes infectées sur trois en quatre jours si elles ne sont pas traitées.

Poinar a dit:

"En 660 ans d'évolution en tant qu'agent pathogène humain, nous avons constaté que relativement peu de changements ont eu lieu dans le génome de l'ancien organisme, mais ces changements, même minimes, peuvent expliquer la virulence accrue du virus qui a ravagé L’Europe suivante: déterminer la cause de la mort. "

La technologie biogénétique rend aujourd'hui la perspective de la récupération d'ADN et du séquençage de spécimens anciens beaucoup plus facile, ont expliqué les auteurs. En comprenant l'évolution des agents pathogènes anciens, nous sommes plus à même de comprendre les caractéristiques et les caractéristiques des infections émergentes et réémergentes.
Sharon DeWitte, de l'Université de Caroline du Sud, Kirsten Bos, de l'Université McMaster, et Verena Schuenemann, de l'Université de Tubingen, ont analysé ce qui restait des squelettes des victimes dans les «fosses de la peste» d'East Smithfield à Londres. Depuis son enterrement, la Monnaie royale a été construite sur le dessus. Ils ont sélectionné des spécimens prometteurs, dont ils savaient qu'ils avaient encore des traces de Y. pestis après un dépistage minutieux, de la pulpe dentaire de cinq victimes.
Les scientifiques ont réussi à extraire, purifier et enrichir les spécimens afin qu'ils puissent identifier l'ADN de la peste, par opposition à l'ADN provenant d'ADN fongique, humain et autre non-peste.
Ils ont pu calculer l'âge de la Yersinia pestis' ancêtre qui a causé la peste noire en reliant les dates 1349-1350 des restes squelettiques aux données génomiques.
La date a fusionné aux alentours du 12ème au 13ème siècle, ce qui signifie que les anciennes plaies étaient probablement causées par un autre pathogène ancêtre. Les experts avaient précédemment cru que, par exemple, la peste justinienne du 6ème siècle était causée par le même agent pathogène que la peste noire médiévale. On pense que la peste justinienne a causé la mort d'environ 100 millions de personnes dans le monde - elle s'est répandue à l'est de l'empire romain oriental et a continué à se propager.

Ecrit par Christian Nordqvist