Les nouveaux protocoles améliorent la détection des microARN pour le diagnostic

Selon une enquête publiée aujourd'hui dans The Journal of Molecular DiagnosticsLes microARN (miARN) qui coordonnent les processus, tels que le développement, le vieillissement et la fertilisation, sont prometteurs en tant que biomarqueurs de la maladie. Les micro-ARN peuvent être collectés régulièrement à partir de fluides tels que l'urine, le sang et la salive. Dans cette étude, les chercheurs présentent des méthodes claires pour collecter et examiner les miARN, améliorant considérablement leur précision diagnostique.
Dominik M. Duelli, chercheur principal, Département de pharmacologie cellulaire et moléculaire, Faculté de médecine de Chicago de l'Université de médecine et de sciences Rosalind Franklin, explique:

"Notre étude démontre que les différences inhérentes aux échantillons biologiques et les méthodes utilisées pour les collecter et les analyser peuvent avoir un impact considérable sur la détection et la quantification des microARN. Nous avons développé des mesures pour surmonter les interférences et augmenter la sensibilité de 30 fois. "

Les scientifiques disent qu'il y a plus de mille miARN dans le corps humain. La dérégulation de miARN spécifiques est liée à la maladie. La mesure de la quantité de miARN dans les fluides corporels peut aider à diagnostiquer des maladies, des conditions ou des développements naturels, tels que la grossesse.
Le Dr Duelli et son équipe ont mesuré la quantification de deux miARN: le MiR-223, impliqué dans certaines maladies malignes, la grossesse et d'autres conditions; et miR-16, qui agit comme un suppresseur de tumeur et est perdu ou dérégulé dans certains cancers, y compris le cancer du sein.
La chercheuse Sarah Linnstaedt, PhD, de l'Université Duke, a déclaré:

«L’impossibilité d’isoler suffisamment de matériel de haute qualité à analyser constitue un défi fondamental pour la large disponibilité des diagnostics de microARN. Notre article décrit les moyens de collecter efficacement des échantillons de plasma sanguin, ce qui nous rapproche de l’objectif de diagnostic de la maladie. réalité."

Les chercheurs rapportent que la quantification est affectée par le choix des tubes de prélèvement sanguin. Ils ont constaté que les meilleurs résultats étaient obtenus avec des tubes à fond gris contenant l'anticoagulant, le fluorure de sodium et l'oxalate de potassium (NaF / KOx), tandis que les tubes traditionnels à sommet vert interféraient presque complètement avec la détection des miARN.
Bien que le miR-16 soit environ 500 fois plus abondant dans le plasma sanguin que le miR-223, les résultats pour les deux étaient comparables, suggérant que les différences de détection résultant du choix de la technique de prélèvement s'appliquent à d'autres miARN. En outre, des résultats plus variables ont été obtenus en recueillant le miR-223 dans le sérum, ce qui indique que pour certains miARN, l'examen du sang sous forme de plasma est favorisé.

Enfin, les chercheurs ont constaté que les différences de structure plasmatique entre donneurs individuels produisaient différentes mesures de miARN.
Dr. Duelli explique:

"Ces résultats soulèvent la possibilité que des facteurs tels que le régime, l'exercice, les rythmes circadiens et les saisons, qui modifient la chimie du sang, puissent affecter la détection et la quantification du miARN.
Les implications de ce travail sont que sans prise en compte de la variable que nous avons identifiée, la quantification des miARN des échantillons humains peut ne pas être fiable aux fins du développement de biomarqueurs. Nous fournissons des approches qui permettent une quantification fidèle de l'abondance des miARN dans les fluides corporels "

Écrit par Grace Rattue